Οι πρωτεΐνες είναι ίσως η σημαντικότερη κατηγορία βιοχημικών μορίων, καθώς πραγματοποιεί τις περισσότερες από τις μοριακές λειτουργίες και παρέχει πολλές από τις μοριακές δομές που υποστηρίζουν τη ζωή.
Σε αυτήν την ιστοσελίδα μπορείτε να διερευνήσετε όλα τα επίπεδα οργάνωσης των πρωτεϊνών: από τις δομικές μονάδες (α-αμινοξέα) και την αλληλουχία τους, ως την πλήρη τρισδιάστατη διαμόρφωση της πρωτεϊνικής δομής.
Μέσα από μια σειρά διαδραστικών μοριακών μοντέλων και animations περιγράφονται οι κρίσιμες δομικές και λειτουργικές ιδιότητες των πρωτεϊνών.
Τα τρισδιάστατα μοριακά μοντέλα απεικονίζονται στο περιβάλλον JSmol της πλατφόρμας HTML5 και είναι συμβατό με τις τελευταίες εκδόσεις των σύγχρονων browsers.
- 1 Δομή και Ιδιότητες
α-αμινοξέωνΓενική δομή ενός αμινοξέος και η αμφιπολική ιοντική μορφή του που επικρατεί σε ουδέτερο pH. - 2 Τα Αμινοξέα των Πρωτεϊνών Κατάταξη των 20 κοινών αμινοξέων με βάση την πολικότητα των ομάδων R τους και η κατάσταση ιοντισμού τους σε ουδέτερο pH.
- 3Πεπτιδικός Δεσμός - Πολυπεπτιδικές ΑλυσίδεςΠαρουσίαση του πεπτιδικού δεσμού και των πολυπεπτιδικών αλυσίδων μέσω ενός φυσικού πενταπεπτιδίου, της μεθειονίνης εγκεφαλίνης.
- 4 Πρωτοταγής Δομή των Πρωτεϊνών Η γραμμική αλληλουχία των καταλοίπων της πρωτεΐνης λυσοζύμης και η σημασία του καταλοίπου κυστεΐνη στη σταθεροποίηση της διαμόρφωσής της στο χώρο.
- 5 Γενική Παρουσίαση της Πρωτεϊνικής Δομής Παρουσίαση των τεσσάρων επιπέδων οργάνωσης των πρωτεϊνών, μέσω μιας τετραμερούς πρωτεΐνης, της αιμοσφαιρίνης, καθώς και των τρισδιάτατων μοντέλων απεικόνισης, μέσω μιας μονομερούς πρωτεΐνης, της μυοσφαιρίνης.
- 6 Δευτεροταγής δομή πρωτεϊνών Η σύσταση των αμινοξικών καταλοίπων προδιαθέτει για την διευθέτηση σε κάποιο τύπο δευτεροταγούς δομής ( α-έλικα, β-πτυχωτή επιφάνεια, β στροφή, α αλυσίδα κολλαγόνου), που σταθεροποιείται με δεσμούς Η.
- 7 Τριτοταγής δομή πρωτεϊνών Το σύνολο των δευτεροταγών δομών και των ενδομοριακών αλληλεπιδράσεων της δομής του ενζύμου λυσοζύμη. Υδροφοβικότητα, ανάλυση φορτίου και σύνδεση του υποστρώματος με το ενεργό κέντρο.
- 8 Τεταρτοταγής δομή πρωτεϊνών Παρουσίαση των τεσσάρων υπομονάδων της αιμοσφαιρίνης (α και β σφαιρίνες). Έμφαση στη δευτεροταγή δομή της β σφαιρίνης, την ομάδα της αίμης και την συναρμογή οξυγόνου στο σίδηρο της αίμης.
- 9 Δομική ταξινόμηση των πρωτεϊνών Παρουσίαση των ινωδών δομικών πρωτεϊνών φιμπροΐνη, κολλαγόνο και των σφαιρικών ρυθμιστικών πρωτεϊνών ινσουλίνη, μεταγραφικός παράγoντας GAL.
- 10 Πρότυπα Αναδίπλωσης Παρουσίαση ενός σημαντικού δομικού μοτίβου από καθεμία τάξη της πρωτεϊνικής δομής : έλικα-βρόγχος-έλικα (όλο α), β σάντουιτς τύπου ανοσοσφαιρίνης (όλο β), φωσφοροφρουκτοκινάση (α/β), τύπου GFP (α+β).
Τμήμα Χημείας / Α.Π.Θ. / 2008 - 2014